Routine Molecular

CellSight ™ DNA

Test code CELL-SIGHT-DNACPT 81459Turnaround 10 to 14 days from specimen receipt
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Test description

A comprehensive genomic profiling test performed on intact circulating tumor cells, not DNA fragments, from a single blood draw. 517-gene panel; reported alterations: single nucleotide variants (SNVs), insertions and deletions (indels), copy number variants (CNVs). Signatures: tumor mutational burden (TMB) and microsatellite instability (MSI). Enumeration: CTC count reported for the entire patient accession. Validated across a range of solid tumors. Laboratory-developed test; not cleared or approved by the U.S. FDA.

Test methodology

Next-Generation Sequencing

Genes tested

517 genes
  • A1CF
  • ABCB1
  • ABL1
  • ABL2
  • ABRAXAS1
  • ACSM2B
  • ACVR1
  • ACVR1B
  • ACVR2A
  • ADAM18
  • ADAMTS12
  • ADAMTS2
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • ALK
  • AMER1
  • ANO4
  • APC
  • AR
  • ARAF
  • ARHGAP35
  • ARID1A
  • ARID1B
  • ARID2
  • ARID5B
  • ASXL1
  • ASXL2
  • ATM
  • ATP1A1
  • ATR
  • ATRX
  • AURKA
  • AURKB
  • AURKC
  • AXIN1
  • AXIN2
  • AXL
  • B2M
  • BAP1
  • BARD1
  • BCL2
  • BCL2L12
  • BCL6
  • BCOR
  • BCR
  • BLM
  • BMP5
  • BMPR2
  • BRAF
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRINP3
  • BRIP1
  • BTK
  • C6
  • C8A
  • C8B
  • CACNA1D
  • CALR
  • CANX
  • CARD11
  • CASP8
  • CASR
  • CBFB
  • CBL
  • CCND1
  • CCND2
  • CCND3
  • CCNE1
  • CD163
  • CD274
  • CD276
  • CD79B
  • CDC73
  • CDH1
  • CDH10
  • CDK12
  • CDK4
  • CDK6
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CDKN2A
  • CDKN2B
  • CDKN2C
  • CHD4
  • CHEK1
  • CHEK2
  • CIC
  • CIITA
  • CNTN6
  • CNTNAP4
  • CNTNAP5
  • COL11A1
  • CREBBP
  • CSF1R
  • CSMD3
  • CTCF
  • CTLA4
  • CTNNB1
  • CTNND2
  • CUL1
  • CUL3
  • CUL4A
  • CUL4B
  • CYLD
  • CYP2C9
  • CYP2D6
  • CYSLTR2
  • DAXX
  • DCAF4L2
  • DCDC1
  • DDR1
  • DDR2
  • DDX3X
  • DGCR8
  • DICER1
  • DNMT3A
  • DOCK3
  • DPYD
  • DROSHA
  • DSC1
  • DSC3
  • E2F1
  • EGFR
  • EIF1AX
  • ELF3
  • EMSY
  • ENO1
  • EP300
  • EPAS1
  • EPCAM
  • EPHA2
  • ERAP1
  • ERAP2
  • ERBB2
  • ERBB3
  • ERBB4
  • ERCC2
  • ERCC4
  • ERCC5
  • ERG
  • ERRFI1
  • ESR1
  • ETV1
  • ETV4
  • ETV5
  • ETV6
  • EZH2
  • FAM135B
  • FANCA
  • FANCC
  • FANCD2
  • FANCE
  • FANCF
  • FANCG
  • FANCI
  • FANCL
  • FANCM
  • FAS
  • FAT1
  • FBXW7
  • FGF19
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FLT3
  • FLT4
  • FOXA1
  • FOXL2
  • FOXO1
  • FUBP1
  • FYN
  • GALNT17
  • GATA2
  • GATA3
  • GLI1
  • GLI3
  • GNA11
  • GNA13
  • GNAQ
  • GNAS
  • GPR158
  • GPS2
  • GRID2
  • H1-4
  • H2BC5
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3C2
  • HCN1
  • HDAC2
  • HDAC9
  • HIF1A
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HNF1A
  • HRAS
  • ID3
  • IDH1
  • IDH2
  • IGF1R
  • IKBKB
  • IL6ST
  • IL7R
  • INPP4B
  • IRF4
  • IRS4
  • JAK1
  • JAK2
  • JAK3
  • KCND2
  • KCNH7
  • KCNJ5
  • KDM5C
  • KDM6A
  • KDR
  • KEAP1
  • KEL
  • KIR3DL1
  • KIT
  • KLF4
  • KLF5
  • KLHL13
  • KMT2A
  • KMT2B
  • KMT2C
  • KMT2D
  • KNSTRN
  • KRAS
  • KRTAP21-1
  • KRTAP6-2
  • LARP4B
  • LATS1
  • LATS2
  • LRRC7
  • MAGOH
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAP2K4
  • MAP2K7
  • MAP3K1
  • MAP3K4
  • MAP3K8
  • MAPK1
  • MAPK8
  • MARCO
  • MAX
  • MCL1
  • MDM2
  • MDM4
  • MECOM
  • MED12
  • MEF2B
  • MEN1
  • MET
  • MGA
  • MITF
  • MLH1
  • MLH3
  • MPL
  • MRE11
  • MSH2
  • MSH3
  • MSH6
  • MTAP
  • MTOR
  • MTUS2
  • MUTYH
  • MYB
  • MYBL1
  • MYC
  • MYCL
  • MYCN
  • MYD88
  • MYOD1
  • NBN
  • NCOR1
  • NF1
  • NF2
  • NFE2L2
  • NLRC5
  • NOL4
  • NOTCH1
  • NOTCH2
  • NOTCH3
  • NOTCH4
  • NRAS
  • NRG1
  • NRXN1
  • NSD2
  • NT5C2
  • NTRK1
  • NTRK2
  • NTRK3
  • NUP93
  • NUTM1
  • NYAP2
  • ODAD2
  • OR10G8
  • OR2G6
  • OR2L13
  • OR2L2
  • OR2L8
  • OR2M3
  • OR2T3
  • OR2T33
  • OR2T4
  • OR2W3
  • OR4A15
  • OR4C15
  • OR4C6
  • OR4M1
  • OR4M2
  • OR5D18
  • OR5F1
  • OR5L1
  • OR5L2
  • OR6F1
  • OR8H2
  • OR8I2
  • OR8U1
  • ORC4
  • PAK5
  • PALB2
  • PARP1
  • PARP2
  • PARP3
  • PARP4
  • PAX5
  • PBRM1
  • PCBP1
  • PCDH17
  • PDCD1
  • PDCD1LG2
  • PDE1A
  • PDE1C
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDIA3
  • PGD
  • PHF6
  • PIK3C2B
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3CG
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIM1
  • PLCG1
  • PLXDC2
  • PMS1
  • PMS2
  • POLD1
  • POLE
  • POM121L12
  • POT1
  • PPARG
  • PPFIA2
  • PPM1D
  • PPP2R1A
  • PPP2R2A
  • PPP6C
  • PRDM1
  • PRDM9
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKAR1A
  • PSMB10
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PTCH1
  • PTEN
  • PTPN11
  • PTPRD
  • PTPRT
  • PXDNL
  • RAC1
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD52
  • RAD54L
  • RAF1
  • RARA
  • RASA1
  • RASA2
  • RB1
  • RBM10
  • RBP3
  • RECQL4
  • REG1A
  • REG1B
  • REG3A
  • REG3G
  • RELA
  • RET
  • RGS7
  • RHEB
  • RHOA
  • RICTOR
  • RIT1
  • RNASEH2A
  • RNASEH2B
  • RNASEH2C
  • RNF43
  • ROS1
  • RPA1
  • RPL10
  • RPL22
  • RPL5
  • RPS6KB1
  • RPTN
  • RPTOR
  • RSPO2
  • RSPO3
  • RUNDC3B
  • RUNX1
  • RUNX1T1
  • SDHA
  • SDHB
  • SDHC
  • SDHD
  • SETBP1
  • SETD2
  • SF3B1
  • SH3RF2
  • SIX1
  • SIX2
  • SLC15A2
  • SLC8A1
  • SLCO1B3
  • SLX4
  • SMAD2
  • SMAD4
  • SMARCA4
  • SMARCB1
  • SMC1A
  • SMO
  • SNCAIP
  • SOCS1
  • SOS1
  • SOX2
  • SOX9
  • SPEN
  • SPOP
  • SRC
  • SRSF2
  • STAG2
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5B
  • STAT6
  • STK11
  • SUFU
  • SYT10
  • SYT16
  • TAF1
  • TAP1
  • TAP2
  • TAPBP
  • TBX3
  • TCF7L2
  • TERT
  • TET2
  • TFE3
  • TFEB
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • TMEM132D
  • TNFAIP3
  • TNFRSF14
  • TOP1
  • TOP2A
  • TP53
  • TP63
  • TPMT
  • TPP2
  • TPTE
  • TRHDE
  • TRIM48
  • TRIM51
  • TRRAP
  • TSC1
  • TSC2
  • TSHR
  • U2AF1
  • UGT1A
  • USP8
  • USP9X
  • VHL
  • WAS
  • WT1
  • XPO1
  • XRCC2
  • XRCC3
  • YAP1
  • YES1
  • ZBTB20
  • ZFHX3
  • ZIM3
  • ZMYM3
  • ZNF217
  • ZNF429
  • ZNF479
  • ZNF536
  • ZRSR2

Specimen requirements

Specimen type
Whole blood
Container
CellSave CTC Preservation Tubes (kit supplied)
Volume
Two 10 mL CellSave CTC Preservation Tubes
Collection
Specimen: Peripheral whole blood
Rejection criteria
Streck and EDTA tubes are not accepted.

Storage & transportation

Room temp 15–25 °C Not specified
Refrigerated · preferred 2–8 °C Not specified
Frozen −20 °C Not specified
Transport temperature
Refrigerated (2–8 °C)
Shipping instructions
Shipped chilled at 2 to 8 °C. Schedule sample pick-up with the lab's logistics team.
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